本发明提供麻精药品全流程闭环管理系统及方法，包括电子档案库，电子档案库中存储多个个人麻精药品电子病历档案库；包括以下步骤：S1：挂号就诊；S2：患者前去门诊药房，根据处方缴费，获得处方缴费凭证；S3：麻精药品电子病历建档或验档；S4：处方归档；S5：废贴回收；S6：发放麻精药品；S7：麻精药品用药。本发明减少医护人员的工作量，避免时间的浪费，为后续查验、追溯提供便利，发放药品之前，对废贴进行回收，进一步的确定患者的身份，防止不法分子冒领、偷领患者的麻精药品，更利于发现异常情况，报警处理，抓获不法分子。