本发明涉及一种高粒度防结块的木糖晶体的制备方法，包括煮糖工艺、降温结晶工艺、离心工艺和干燥工艺。本发明通过改进煮糖工艺，增大生成木糖晶体的粒径，通过改进降温结晶工艺，稳定降温速率使木糖晶体稳定增大等措施，制备一种高粒度防结块的木糖晶体。相比现有工艺，本发明的制备方法的生产周期大大缩短，由原先一个批次100h以上减为50h，木糖晶体产品质量大大提高。采用本发明方法制备的木糖晶体产品，平均粒度30～80目占比可达50％以上，且存放6个月内不结块、不发生变化，可进行长时间运输。