本发明公开了一种CAP系列核电厂超设计基准事故废液的处理系统和方法，属于核电厂放射性废液处理领域。本发明针对CAP系列核电厂超设计基准事故废液的特点，采用紧凑、高效、操作简单、运行维护方便的选择性吸附工艺，形成了适用于高硼酸、高磷酸三钠背景的超设计基准事故废液处理系统，其包括：过滤装置；与过滤装置出口相连的介质床；介质床组设置于密封装置内，密封装置设有入风孔和排风孔，入风孔、排风孔位置处设置迷宫墙结构，且所述密封装置具有核屏蔽作用，入风孔和排风孔的设置解决了实际应用过程中存在的装置灵活性差、辐射防护、衰变热的导出以及废介质排放等工程问题。