本发明涉及开关磁阻电机技术领域，且公开了一种低损耗开关磁阻电机及其控制系统，包括机壳，所述机壳的内部固定安装有若干组定子模块，所述机壳的内部转动安装有转轴，所述转轴的表面安装有若干组转子模块，所述转子模块与所述定子模块一一对应；若干组所述转子模块包括固定转子模块和活动转子模块；该低损耗开关磁阻电机及其控制系统，通过定子模块的独立式设计以及转子模块中固定转子模块和活动转子模块的组合设计，可根据开关磁阻电机的运行转速和负载扭矩需求，选择对应组数的定子模块和转子模块，从而使开关磁阻电机能够达到所需的运行转速和负载的情况下，减少无做工的转子模块对转轴造成的转动负载。