本发明公开了一种外壳自动化钻孔流水线，包括钻孔机和用于输送外壳的输送装置，还包括第一限位装置和夹持运输装置，所述第一限位装置限制外壳垂直于输送装置移动方向上的相对位置，所述输送装置将外壳输送至预定位置，所述夹持运输装置夹持预定位置上的外壳，并矫正其平行于输送装置移动方向上的位置，将其运送到目标位置，所述钻孔机用于对目标位置的外壳进行钻孔。本发明的第一限位装置使得外壳沿输送带移动时，限制其在宽度方向上产生位移，夹持运输装置的夹板打开并移动到外壳的两端，再将夹板收缩，在该过程中，夹板能推动偏移的外壳至预定位置并夹紧后移动到钻孔工位上进行钻孔，从而实现了钻孔的较高的精度。