本发明公开了陆地棉GhCRP21基因及其编码蛋白和应用。本发明公开了从陆地棉中分离的GhCRP21基因，其多核苷酸序列为SEQ ID No.1所示，其编码蛋白的氨基酸序列为SEQ ID No.2所示。本发明综合采用基因表达模式分析、亚细胞定位、病毒诱导基因沉默和转基因等分子生物学技术，以棉花品种‘R15’为试验材料，验证从陆地棉中分离克隆的GhCRP21基因的生物学功能及其在抗黄萎病方面的功能，试验结果表明陆地棉GhCRP21基因可正向调控棉花抗大丽轮枝菌反应，在提高植物对黄萎病抗性或培育抗黄萎病植物品种等方面具有应用前景。