本发明提供了一种百合药材基原的薄层检测方法以及鉴别方法，其中，一种百合药材基原的薄层检测方法，包括：吸取供试品溶液点于硅胶G薄层板上，以质量比为(16‑20)：(1.8‑2.2)：(1.2‑1.8)：(0.8‑1.2)的乙酸乙酯‑甲醇‑甲酸‑水为展开剂，展开，取出，晾干，喷以5％‑20％硫酸乙醇溶液加热至斑点显色清晰，置365nm的紫外光灯下检视即可。本发明能够有效获取显著斑点更多的百合药材的薄层色谱，且针对不同基原的百合药材，所显示的物质信息丰富且存在明显的差异；因此可以有效判断出百合药材的基原，有效实现百合药材的基原的鉴别。