本申请公开了一种磁控变压器测试方法及系统，该方法应用于磁控变压器测试系统的上位机中。上位机连接电网模拟器、电源模拟器、电子负载、示波记录仪及功率分析仪，磁控变压器连接有电网模拟器、电源模拟器及电子负载，磁控变压器的原边及副边连接有功率分析仪及示波记录仪；该方法包括确定测试方式；基于测试方式，对磁控变压器在不同应用工况下的性能进行测试；实时获取磁控变压器的功率数据及波形数据；基于获取的功率数据及波形数据，对磁控变压器的性能进行评估。可见，本申请可以使用磁控变压器测试系统中的上位机，评估磁控变压器在不同应用工况下的性能，并及时获取功率数据及波形数据，进一步提高了评估的可靠性。