本发明公开了一种微波灭杀土壤病虫草害的装置，其包括机架，所述机架底部四角处分别设有一个万向轮，所述机架的前端设置有连接扣，所述机架上设有微波发生源，所述微波发生源的一侧连接有波导管，所述波导管上连接有2个以上的倒L型支管，所述倒L型支管的底部设有微波馈口，所述微波馈口连接有微波防护罩，所述微波馈口和微波防护罩的连接处设有温度传感器，所述机架上还设有微波源控制模块和电源控制箱，所述微波源控制模块内设有PLC控制器用于控制微波发生源工作和接受温度传感器的数据信息。本发明利用微波的热效应和生物效应对土壤中的病虫草害进行灭杀，减少作物土壤的病虫草害，同时无毒、无残留、不产生抗药性。