本发明涉及自由空间光通信的技术领域，且公开了双极性编码的密集波分复用自由空间光通信系统、方法，所述系统包括光无线通信方式选择模块、光无线通信中继建立模块、光无线通信传输路径规划模块；通过光无线通信发射端、目标接收端的通信信号容量结合数学公式精确计量出光无线通信传输过程衰减量数据，实现基于双极性编码和密集波分复用的光无线通信信号干扰强度量化处理；利用光无线通信信号容量衰减量与安全容量衰减量进行数值比对，精确分析出光无线通信干扰状态并依据通信干扰状态为光无线通信智能分类匹配出安全通信传输方式，提高了自由空间光通信的适用性。