本发明属于测量技术领域，涉及一种基于反卷积的多波束合成孔径声呐高分辨成像方法。该方法包括：步骤（1）：通过二维基阵在航迹向上的走航，虚拟合成大孔径基阵，经合成孔径算法处理获得多幅二维声呐复图像；步骤（2）：利用合成孔径声呐复图像，针对一维虚拟线阵结构进行常规波束形成输出，获得三维多波束合成孔径声呐图像；步骤（3）：根据一维虚拟线阵结构，计算系统点扩展函数；步骤（4）：结合三维多波束合成孔径声呐图像输出及系统点扩展函数，利用基于外推矢量及加速指数的R‑L算法，经反卷积获得多波束合成孔径声呐三维高分辨图像。本发明的方法有助于水下目标的精细化探测，减少成像算法计算量的同时增强实时性。