本发明涉及能源领域，特别是一种灵活性改造机组耦合综合能源供热系统。当前沼气发电系统处理畜禽粪污生成沼气发电功能单一，无法同时为家庭供热水与供热。为此本发明提供一种灵活性改造机组耦合综合能源供热系统，与现有灵活性改造发电机组耦合，维持沼气发电的同时为住户家庭提供生活热水和取暖供热。本发明包括预处理装置、匀浆池、厌氧发酵装置与沼液处理装置，预处理装置可输入畜禽废弃物，沼液处理装置用第一管道和沼气管道分别输出连沼液池和沼气罐，沼气罐设管路接沼气发电机和家庭灶具，沼气罐输出连接沼气热水器，沼气热水器设有至少一个接自来水的进水口，沼气热水器的出水口接热水罐，热水罐可为家庭用户提供生活热水和供热取暖。