本发明公开了一种含六元碳氮杂环的自组装超分子材料及其制备方法与应用，属于半导体技术领域。所述含六元碳氮杂环的自组装超分子材料的制备步骤包括：将单体1与单体2溶于溶剂中，反应后除去溶剂，剩余物即为含六元碳氮杂环的自组装超分子材料；所述单体1与单体2的组合为2,4,6‑三氨基嘧啶与巴比妥酸组合，或2,6‑二氨基吡啶与三聚氰酸组合。本发明发现了一系列新的六元碳氮杂环小分子单体的自组装体系，开发了新的通过六元碳氮杂环小分子单体自组装合成的超分子前驱体，进一步通过热解将前驱体转化为结晶良好、耐热性能优异的石墨化碳质材料。