本发明公开了一种复杂供水网络结构化表达方法和系统，所述复杂供水网络结构化表达方法包括：确定复杂供水网络的网络要素；根据复杂供水网络边界为依据，划定复杂供水网络空间范围；识别网络空间范围内的工程功能，并确定所述工程功能与所述网络要素间的对应关系；基于所述对应关系，对所述复杂供水网络模块化处理，得到若干模块；标记各模块的属性；基于各模块的属性，生成所述复杂供水网络的结构化表达结果。本发明既能对供给侧“水源—水利工程—分区企业”3级供水网络系统进行概化，满足实体水资源供‑用‑耗‑排‑回用水循环互聩配置的技术需求，又能与需求侧企业产品生产耗水相衔接，为实体水—虚拟水统筹配置提供支持。