本发明提出一种基于GNN‑LSTM的县域冬小麦估产分析方法和系统。其中，方法包括：在研究区内计各个县的冬小麦单产数据，然后将其制作带有标签的量产文件，并转化为县域邻接矩阵文件；获取遥感影像和气象数据；在所述遥感影像和气象数据中选择估产分析模型的输入特征；应用所述输入特征、带有标签的量产文件和县域邻接矩阵文件制作训练集和测试集；应用训练集对估产分析模型进行训练和模型调参；应用测试集对训练好的估产分析模型预测县域的冬小麦产量，并对估产分析模型的训练结果进行评价。本发明提出的方案能够看到，预测和真实产量值的空间分布趋势也大致相同，高值和低值的空间展布是温和的，在空间上的预测效果也很好。