本申请公开了一种水库调度数据偏差处理方法，包括，获取水库调度的目标水库的各水位传感器的水位监测数据，并基于所述水位监测数据的变化趋势对各水位传感器进行故障的初始判断；基于所述水位监测数据创建各水位传感器的数学模型，利用所述数学模型对各水位传感器偏差的水位监测数据进行在线分析和自适应修正；对修正后的所述水位监测数据进行验证；利用验证符合要求的水位监测数据，执行水库调度。本申请实施例的水库调度数据偏差处理方法，能够实现对水位传感器数据偏差进行实时分析和修正，提高水位传感器异常的检出率以及检测效率，充分利用上中游水库间的错峰调节关系，保障上中游水资源的有效利用，提升全流域调度水平。