本发明公开了一种适用于旋转机械的空间相异轴向标校方法。该适用于旋转机械的空间相异轴向标校方法，包括以下步骤：S1，旋转机械初始参数设定；S2，旋转机械原始旋转数据采集预处理；S3，旋转机械旋转数据归一化；S4，旋转机械三矢量联立；S5，旋转机械两系定姿；S6，固定限位校正补正；S7，校正矩阵评估；S8，对齐校准综合数据联立；S9，对齐校准综合评估。本发明通过得到旋转机械不同坐标系下的方向余弦矩阵，旋转矩阵和校正矩阵，进而对对齐校准综合评估，达到了提高对旋转机械的标校方式的直接性和可靠性的效果，解决了现有技术中存在标定流程繁琐和传递关系过多的问题。