本发明公开了一种微能源群网的主网鲁棒优化调度方法及系统，方法包括：分别建立微能源群网和主网的调度模型，以购买/售出电量作为决策变量；对主网调度模型求解得到决策变量的初始值，然后基于决策变量的初始值开始迭代求解主网和微能源群网调度模型中的决策变量，直至某一轮迭代求解得到的微能源群网与主网调度模型的决策变量之间的差值的绝对值小于或等于预设值，将最后得到的最优调度方案输出。本发明通过在主网和微能源群网调度模型中分别迭代求解决策变量，得到满足收敛条件的决策变量，鲁棒性强，能有效解决由于相互影响以及较强的耦合性导致微能源群网和主网调度优化求解困难的问题。