本发明公开了一种安全文件存储设备及其操作方法，包括支撑板，所述支撑板上表面一侧通过安装组件安装有安装板，所述安装板设置有两个，两个所述安装板之间固定连接有存储盘，所述存储盘外侧设置有两个防护板，两侧所述防护板安装于固定组件上，所述固定组件固定连接于支撑板两侧表面，另一侧所述安装板一侧表面下方固定连接有固定板，所述固定板两侧设置有螺纹孔，另一侧所述安装板一侧表面中部安装有若干个均匀分布的连接端子，另一侧所述安装板一侧表面上方安装有线路连接线，本发明通过防护板上表面中部设置有通风孔，一侧通风孔内壁固定连接有固定支架，固定支架之间安装有风扇，通过风扇就可以对存储盘起到降温散热的作用。