本发明公开了一种分解平抑风电功率波动混合储能系统控制方法，涉及风电平抑控制领域，包括获取原始风电功率信号计算功率波动率。获取标准卡尔曼滤波器下总储能平抑功率信号到最平滑并网功率信号和储能平抑功率信号控制器1获取储能充电功率PPESES20(t)(t)和储能放电；通过优化卡尔曼滤波器得PES功率1(t)。PES采用功率3(t)。通过功率控制器2实时获取混合储能SOC，根据SOC分配储能控制功率。利用低通滤波器进行二次分配，超级电容器平抑高频波动，蓄电池平抑低频波动，获得混合储能系统的功率分配信号。本发明可根据储能SOC调整下一时刻储能系统动作功率，双目标并网功率可以保证平滑风电功率波动的同时，改善储能系统过充、过放现象，优化风电并网功率，延长储能设备使用寿命。