本发明属于电力系统分析技术领域，具体提供了特高压直流极母线差动保护启动定值快速整定方法及系统，能够快速、准确地整定校核保护定值。方法包括：步骤1，获取样本数据，并划分为条件数据和真实数据；步骤2，将条件数据与真实数据均进行数据处理转换为二进制数；步骤3，构建条件生成对抗网络，并进行训练；条件生成对抗网络包括条件生成器和条件判别器；将条件数据作为条件生成器的输入数据；条件判别器的输入数据包括：真实数据与条件生成器的输出数据形成的需要进行判别的数据，和用于拼接的条件数据；步骤4，采用训练好的条件生成对抗网络，输入当前工况下的实时数据，生成相应的临界故障电阻值，确定极母线差动保护启动定值是否合适。