本发明公开了一种潜水永磁电机装配中转子入壳时隔磁装配方法，解决了如何在隔磁下顺利完成潜水永磁电机转子的入壳装配的问题；在装配工作台（1）上，立式放置电机机座及定子（3）；制作转子入壳用吸附式的气隙隔磁板（7），将气隙隔磁板吸附到电机转子（4）上，将整个电机转子（4）上的永磁磁极覆盖，通过吊装起重设备（5）将吸附有气隙隔磁板（7）的电机转子（4）吊起，入壳到立式放置的电机机座及定子（3）中，将装配在一起的电机转子与电机机座及定子从立式放置改成卧式放置；将长螺杆（8）从还未安装电机端盖的一端伸入到电机中，将气隙隔磁板（7）从定子与转子之间的气隙中拽出；便捷实现了潜水永磁电机的入壳装配工作。