本发明公开了雨季减少菜地土壤氮素淋洗的地下水位区域调控系统，涉及农业环境技术领域，该系统包括：储水井；将田块划分为多个区域，每个区域内设置有至少一个所述储水井，所述储水井预埋于地下，所述储水井与地面之间通过渗水通道连通。本发明整体结构紧凑、设置合理，将田块划分为多个区域，每个区域设置一个预埋于地下的储水井，从而区域调控浅层地下水位，避免雨季地下水位升高至氮素高累积的土壤层，减少地下水－剖面土壤相互作用下土壤累积氮素的流失。