本发明涉及并网燃煤机组灵活性运行技术领域，提供了一种并网燃煤机组灵活运行AGC性能在线评价方法及系统。所述方法包括：调用机组运行历史数据，提取AGC数据段，进而进行AGC数据段运行工况划分，对每一工况子空间进行AGC性能评价模型训练；确定该AGC数据段对各个工况子空间的隶属度，调用已训练好的各工况子空间的AGC性能评价模型，对机组的AGC性能进行在线评价。所述系统包括机组AGC运行工况划分及模型训练模块和机组AGC性能在线评价模块。本发明适用于火电厂机组运行的各种工况，解决火电厂机组AGC性能受负荷率、主蒸汽压力、总阀位、主汽流量、给煤量等影响，难以准确评价的问题。