本发明公开了一种彩色超疏水涂层的制备方法及应用，将一定量十八烷基三氯硅烷、水性涂料色浆和正己烷超声混合，喷涂在基材表面或将基材在溶液中浸泡后，即可得到彩色超疏水涂层。本发明通过无氟环保的方法获得了一种具有优异疏水性且色彩鲜艳的涂层，可以简单通过三原色原理来控制涂层的颜色，实现丰富多彩的表面。本发明获得的彩色超疏水涂层具有优良的装饰性，有较强艺术感，可以涂覆在各种基材上，如纸张、织物、墙面等。此外，用本发明涂层改性所得的滤纸和棉织物还可用于油水分离。