本发明公开了一种基于一次性密码的分离式文件校验方法和装置，该方法包括：接收客户端发送的第一验证参数；第一验证参数为客户端基于约定秘钥和第一时间计数值生成；基于约定秘钥和第二时间计数值生成第二验证参数；第二时间计数值包括与所述第一时间计数值的差值小于预设阈值的范围内的多个时间计数值；将所述第一验证参数与所述第二验证参数进行比较，若存在所述第一验证参数与所述第二验证参数相同，确定所述客户端验证成功。本发明通过基于客户端和服务器双方的约定秘钥和时间计数值生成相应的验证参数，无需用户手动同步计时器，提高了客户端验证环节的智能性和效率，且允许时间计数值之间存在细小偏差，增加了验证结果的容错性。