本发明公开一种测序饱和度评估方法及装置、设备及存储介质，所述方法包括:构建表征测序饱和度与测序深度之间关系的测序饱和度评估模型；其中所述测序饱和度评估模型为以测序序列数量为自变量、测序饱和度为因变量、发现独特序列的最大速率为第一常参数和达到所述最大速率一半时的测序深度为第二常参数的函数关系模型；在测序流程中，获取目标测序饱和度，基于所述目标测序饱和度和所述测序饱和度评估模型，通过所述测序饱和度评估模型预测所述目标测序饱和度对应的估计测序序列总量；基于所述估计测序序列总量和当前测序序列量，进行当前测序饱和度评估。