本发明公开了一种基于电流时域积分量的直流配电网后备保护方法及系统，属于电力系统及其自动化技术领域。本发明，包括：获取中压柔性直流配电保护系统的历史故障数据，基于所述故障数据，确定故障电流时域特征，并基于所述故障电流时域特征构造电流时域积分量；基于所述电流时域积分量，构造差动保护判据；获取中压柔性直流配电保护系统的故障数据，基于所述差动保护判据对故障数据进行判断，基于判断结果执行保护动作。本发明计算量小，采样频率要求低，易于实现。