本发明公开一种基于主从博弈的电力系统柔性负荷优化调度方法及系统，该方法步骤包括：构建主从博弈模型，将柔性负荷用户作为模型中下层跟随者，以及将柔性负荷提供方作为模型中上层领导者；以调控裕度和用户用能满意度最优为调度目标构建下层跟随者模型；以柔性负荷提供方运行成本最优为目标构建上层领导者模型；配置初始状态后，上层柔性负荷提供方对负荷调控容量、下层柔性负荷用户对出力负荷按照主从博弈模型进行博弈迭代；对主从博弈模型进行模型求解，得到上层柔性负荷提供方的各柔性负荷出力与下层柔性负荷用户参与调控的出力负荷用户的最优解输出。本发明能够实现既满足柔性负荷提供方目标需求，又满足用户体验需求的最优柔性调度。