本发明涉及一种量化功能性血流动力学参数的系统和方法，该系统包括心脏CTA图像获取单元、感兴趣病变区域分割单元、数值模拟单元和患者特异性边界条件设置单元；心脏CTA图像获取单元用于采用非对比心脏CT测量主动脉瓣钙化评分；采用回顾性心电图门控法获取主动脉根部的全心周期数据，并以5%的心周期间隔重建整个心周期的多相数据；当完全全相位数据采集不可行时，根据冠状动脉运动自动确定最佳的收缩和舒张相位；感兴趣病变区域分割单元用于分割计算域和左心室容积；患者特异性边界条件设置单元用于将入口边界条件设定为由左心室容积变化决定的平均血流量；数值模拟单元用于采用刚性壁稳态血流模型进行模拟，得到主动脉瓣的平均跨瓣压差。