本发明提供一种水溶液体富硒肥料及其制备方法，涉及液体肥料制备领域。该水溶液体富硒肥料，包括以下克重的成分：硫酸亚铁100‑500g、硝酸钾100‑500g、硫酸锰80‑360g、硫酸锌30‑120g、硼酸50‑200g、磷酸二氢钾250‑500g、硫酸镁200‑400g、二氧化硅20‑70g、富硒天然海藻提取物25‑60g和蒸馏水1000g。通过采用富硒天然海藻提取物作为添加剂，可以提高植物对硒元素的吸收和利用率，并且在制备过程中采用加热处理，减少内部残渣的处理，提高溶解和吸收效率，同时使用二氧化硅作为填料，可以增加肥料的稳定性和持久性，延长肥料的使用时间和使用寿命。