本发明公开了一种烟草抗病促生的复合菌粉的制备方法及应用，属于烟草抗病促生的复合菌株筛选及菌粉制备技术领域，制备过程为取病发植株周边健康植株深5～15cm处的根围土壤，将土壤混合均匀后，加入无菌水，静置后将上清液接种于TBS培养基上，富集培养36h，传代两次获得二级种子液；将二级种子液以10％的接种量接种到发酵培养基中培养30h，得到液体菌种；向白炭黑中加入上述液体菌种，不断搅拌使载体充分吸附，当载体不结块且烧杯中无流水时停止加入液体菌种，晾干后经气流粉碎机粉碎即为母粉；对母粉进行机械过滤，形成滤饼；对滤饼喷雾干燥制成菌粉。将该菌粉与膨润土、生物炭混合制备成复合微生物菌剂，可以显著降低烟草的青枯病和黑胫病的发病指数。