本发明给出了一种高纯净铍铜中间合金的制备方法，属于铍铜合金冶炼技术领域，该方法包括：按照3.3～10：96.7～90的质量比称取铍边角料和电解铜；将1/2～2/3质量的铍边角料和电解铜装入真空熔炼炉中后抽真空，并加热升温至1320～1380℃下进行真空熔炼；在氩气气氛保护下，将剩余的铍边角料和电解铜与真空熔炼物一起，加热升温至1320～1380℃进行真空熔炼；在氩气气氛保护下，将真空熔炼物进行真空电磁力搅拌，得到金属液；在氩气气氛保护下，将所述金属液于1190～1230℃下倒入模具中后冷却凝固。本发明能够利用铍边角料制备出纯度高的铍铜中间合金，成本低，环境污染率低。