本公开提供了基于资源使用率预测的作业超量分配调度方法及系统，涉及高性能计算的作业调度技术领域，若目标作业为长作业，则将长作业注册到资源使用率预测模块的工作队列中，获取实时的各节点的资源使用率数据，并输入至资源使用率预测模块预测所有运行长作业的节点未来设定时间各类资源的使用率情况，并使用调度算法根据资源使用率预测模型输出的预测数据确定最优运行节点；若目标作业为短作业，则根据其总体资源使用率的估计值在所有运行长作业的节点中进行匹配，并分配到最佳匹配节点；本公开有效解决了集群中的资源闲置问题。