本发明属于核设施运行技术领域，具体涉及一种核设施运行核安全指标量化方法和系统。包括数据处理模块，安全数据库，权重组生成模块，计算模块和展示及报告模块；所述的数据处理模块对输入的故障数据进行预处理，然后存入安全数据库。展示及报告生成模块是用户交互控制的人机接口，通过展示及报告生成模块进行参数设置，通过权重生成模块或计算模块进行计算，生成数据存入安全数据库，计算模块和展示及报告模块再对计算结果进行展示。有益效果在于：通过该指标体系既能为现役核设施在一定运行周期内的运行核安全性能提供定量化的直观数据，也能为核安全监管部门的监督管理和运行维修保障部门的运行维护提供依据，提高核设施的运行核安全水平。