本发明公开了一种磷酸的高效率除杂方法及除杂系统，具体包括以下步骤：S01、1～10份水、1～5份苯乙烯聚合物、1～5份异戊烯聚合物、1～5份茚满；S02、向反应釜内按1～4:1的比例加入低活性磷酸：纯水后搅拌稀释；S03、按1～6:10的比例加入纯度为99.9％的氯苯溶剂：稀释后的低活性磷酸反应进行萃取；S04、低活性磷酸对下层磷酸进行脱色；S05、进行负压蒸馏将下层磷酸脱水至80％～90％之间得到高活性磷酸。本发明提供的磷酸的高效率除杂方法及除杂系统，采用氯苯溶剂对低活性磷酸进行除杂，氯苯溶剂能够回收通过蒸馏后多次使用，降低整体除杂成本，并且活性炭也属于可回收的过滤材料，起到环保的作用，在除杂后的磷酸活性高，在与茚满合成后收率增加，以降低整体成本。