本发明公布了一种反应容器的清洁系统及方法，属于清洁系统技术领域，包括反应容器，还包括超声波发生器以及临时储液罐，反应容器内设置有清洁喷头，清洁喷头与远程等离子体单元连接，远程等离子体单元与清洁剂存储组件连接，清洁剂存储组件、超声波发生器、远程等离子体单元、清洁检测器和清洁喷头与清洁控制器相连；反应容器与临时储液罐之间通过管路循环连接。本发明能够对反应容器进行清洁和表面改性，去除反应容器内表面上的不期望材料，同时改变反应容器的表面性质，提高反应的效率、质量和安全，减少反应的停机时间，节省清洁剂的用量，降低清洁的运行费用，减少清洁剂对环境和人体的危害，避免清洁过程中产生的污染物的处理问题。