本发明公开了一种香港牡蛎耐高盐基因CALM及其siRNA‑CALM序列和应用，本发明从香港牡蛎转录组中筛选并克隆获得CALM基因片段，根据香港牡蛎CALM基因序列设计并合成siRNA，命名为siRNA‑CALM。在高盐度胁迫条件下通过注射闭壳肌的方法导入到香港牡蛎体内，干扰并抑制香港牡蛎体内CALM基因的表达，检测干扰后CALM基因的表达和定位分布变化、受CALM基因调控的钙信号通路关键基因以及关键酶活性变化、鳃组织形态结构变化及细胞凋亡情况等，系统性分析钙信号通路在香港牡蛎高盐胁迫下的作用及其调控机制。本发明注射剂量较小，能够降低成本，可以有效影响CALM引导的钙信号通路对香港牡蛎高盐耐受性的调控。