本发明提供了毛发中苯丙胺的检测方法，包括以下步骤：预处理阶段，毛发样品和溶剂送研磨单元内研磨，之后送离心机，提取上清液；取样阶段，利用毛细管尖端蘸取上清液；检测阶段，将所述毛细管置于脉冲直流电喷雾离子源中，所述毛细管内的电极放电，形成电喷雾，离子送质谱分析仪，质荷比扫描范围为50‑2000；所述毛细管内上清液和所述电极端部的距离为5mm‑25mm，所述尖端的内径是25μm‑50μm，所述电极上的电压为2KV‑3KV。本发明具有检测快速、灵敏度高等优点。