本发明涉及芯片技术领域，尤其涉及一种芯片文件版本管理系统，包括第一版本管理工具、第二版本管理工具，以及与所述第一版本管理工具和第二版本管理工具相连接的同步模块；所述第一版本管理工具包括第一存储仓，所述第二版本管理工具包括第二存储仓；所述第一版本管理工具用于接收用户提交的芯片文件F，生成芯片文件F对应的第一版本信息，并将芯片文件F和对应的第一版本信息存储至第一存储仓中；所述同步模块用于从第一版本管理工具中获取芯片文件F和对应的第一版本信息，并同步至所述第二版本管理工具中。本发明能够自动化实现不同版本管理工具中芯片文件的同步，提高了芯片开发的效率。