本发明实施例提供一种燃气电厂综合效率优化方法及系统，属于燃气电厂技术领域。所述方法包括：采集电解质水装置的运行参数，并基于所述电解水装置的运行参数确定氧气产出性能和氢气产出性能；基于所述氢气产出性能模拟甲醇合成性能，并基于所述氧气产出性能和所述甲醇合成性能确定掺混基础信息；通过目标电厂实时运行参数构建热平衡计算模型，并基于所述掺混基础信息和所述热平衡计算模型确定掺混方案；执行所述掺混方案，并在执行过程中实时修正掺混方案，直到完成掺混。本发明方案实现了机组燃料掺混系统与燃气机组燃烧系统耦合控制，在安全阈值内提升机组的透平前温，降低机组在全工况的能源消耗，提高机组运行经济性。