本发明提供了一种用于净气型储药柜的自动化管理与安全预警方法及系统，涉及通风净气管理技术领域，该方法包括：对净气型储药柜内的空间划分为P个栅格区域；获得P个浓度集合，以及P个净化效率，并计算获得所述净气型储药柜内的总加权浓度；获得P个异常值和综合异常值；获得预警信息；在所述预警信息内包括进行预警时，构建约束条件；根据所述目标函数和约束条件，获得最优通风净气参数组合，对所述净气型储药柜进行管理，解决了现有技术中存在预警结果不准确，且通风净化管理效果不佳的技术问题，实现对净气型储药柜的自动化管理，达到及时对预警信息进行处理，提升预警管理的精度和准确度的技术效果。