本申请提出一种变压器全生命周期碳足迹不确定性分析方法及系统，所述方法包括：建立变压器全生命周期的能量消耗清单和废物排放清单；建立变压器的生命周期评价模型；根据所述能量消耗清单和废物排放清单收集变压器的碳排放数据，根据碳排放数据计算变压器全生命周期的碳足迹；确定影响变压器碳足迹的不确定性因素，确定各不确定性因素的参数波动范围及概率分布；对各不确定性因素进行拉丁超立方抽样产生数据样本；把数据样本输入所述生命周期评价模型得到各数据样本对应的变压器全生命周期碳排放结果；分析所述碳排放结果得到各不确定性因素对变压器全生命周期碳排放影响的不确定度。