本发明提供了一种油井智能电磁加热清蜡系统及清蜡方法，涉及油井清蜡领域，包括井上部分和井下部分，所述井上部分包括远程监控设备、智能控制柜、入井电缆、井口密封器，所述远程监控设备与智能控制柜电连接，所述入井电缆一端与智能控制柜连接，另一端与所述井口密封器连接；所述井下部分包括井下电缆、油套接触器，所述井下电缆的一端与所述井口密封器连接，另一端与油管连接，电源变压器能量经智能控制柜隔离调整，传输到井口密封器后经井下电缆传到油管，经油套接触器后与套管连通，形成一个完整的回路。油管本身具有阻抗，作为发热体，电流流过时产生热量，对油管上的蜡进行电磁加热清蜡，清蜡效果明显。