本发明涉及光波导的耦合领域，具体涉及一种光纤阵列耦合器的自适应控制方法及系统，该方法包括：获取压电瓷片驱动电压和光功率的历史数据；构建光功率空间；对电瓷片驱动电压和光功率拟合出高斯二维分布，对历史数据坐标点与高斯二维分布进行分析，构建短时噪声特征值；进一步对短时噪声特征值的分布特点进行分析，构建短时噪声预测值；根据不同时刻的短时噪声特征值的相似程度获取噪声相似系数；结合对应高斯二维分布的中心坐标获取方向扰动向量，通过神经网络模型完成光纤阵列耦合器的自适应控制，能够根据环境噪音的变化进行自适应的调整，保证光通信效果的质量。