本发明涉及野生动物保护技术领域，公开了一种路网对野生动物阻隔效应指数计算方法及系统，具体包括以下步骤：获取野生动物生存区域内的道路信息，确定每个道路等级下道路的总长度；确定每个道路等级下不同野生动物种类所处的生境类型权重；确定每个道路等级下道路及其周边环境中不同野生动物种类的分布概率；确定每个道路等级下不同野生动物种类的回避距离；计算道路阻隔效应指数；综合考虑重点路段、重点区域周边不同野生动物种类所处的生境类型，根据生境类型赋予权重，对野生动物阻隔效应小的路段，赋予较小的生境类型权重，反之则赋予较大的生境类型权重，加上生境类型权重对于阻隔效应指数的计算更加准确，提高计算精度。