在本申请提供的变压器匝间短路故障溯源方法、存储介质及计算机设备中，获取变压器发生匝间短路故障时的实际端口电流波形；接收变压器用户发送的变压器多种预估短路原因；构建变压器有限元模型，变压器有限元模型包括绕组，绕组包括短路部分和未短路部分；对于每种预估短路原因，根据该预估短路原因，对变压器有限元模型中绕组的短路部分和未短路部分分段建模，采用分段建模后的变压器有限元模型对该预估短路原因仿真，得到每种预估短路原因的仿真端口电流波形；计算实际端口电流波形与每种预估短路原因的仿真端口电流波形的互相关系数，根据每个互相关系数，确定变压器的匝间短路故障原因。如此，可以降低人工检测成本和减少有限元模型仿真时间。