本发明公开了circHIF1α在制备抵御细菌感染的新型疫苗中的应用，涉及生物医药技术领域。该circHIF1α的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明使用副猪格拉瑟菌(G.parasuis)作为革兰氏阴性菌的代表，2型猪链球菌(SS2)和金黄色葡萄球菌(S.aureus)作为革兰氏阳性菌的代表，从体外层面研究circHIF1α在上述细菌对宿主细胞的黏附以及入侵过程中发挥的重要作用，并从体内层面研究circHIF1α对细菌感染的抑制作用，结果证实circHIF1α能够抑制细菌对宿主细胞的黏附以及入侵，从而可以减少细菌对机体的危害。