本申请实施例提供了一种差异性谐波数据保护方法，包括根据指定时间内是否需要用电，将相同线路供电的每个用户的负载分为灵活负载和非灵活负载，设置负载的权重；根据灵活负载和非灵活负载的负荷容量和权重，计算每个用户的加权负荷；根据加权负荷，计算用户重要程度指标并分为多个用户重要程度；获取谐波数据，根据用户重要程度指标，在谐波数据中加入噪音，将加入噪音后的谐波数据作为第一谐波数据；获得谐波数据与第一谐波数据的差异指标，根据第一谐波数据足否符合用户重要程度与差异指标的预设对应关系，保留或舍弃第一谐波数据，直至最终获得保留的第一谐波数据以进行数据传输和共享，确保谐波数据安全性，避免威胁电网安全。