本发明涉及生物医用材料表面改性领域，提供了一种锌合金表面高结合强度抗菌抗凝涂层的制备方法。该方法先对锌合金表面进行常压等离子体处理，提高锌合金表面粗糙度。然后在处理后的锌合金表面构建由a、b、c三种组分构成的复合涂层。其中a层为磷酸锌（ZnP）涂层，可以抑制锌合金在降解过程中Zn2+的过度释放，改善锌合金的生物相容性和抑菌性；b层为基于儿茶酚(CA)和聚乙烯亚胺(PEI)交联的有机涂层，主要作用为连接a和c层；c层由肝素（Heparin,Hep）药物涂层构成，赋予锌合金基体所需的抗凝血功能。本发明采用上述方法所得的多功能复合涂层，由ZnP、CA/PEI和Hep三种成分构成，可有效实现对锌合金基底的保护，在锌合金支架用涂层材料领域具有良好的应用前景。